Voor analyse van koolstofverbindingen die door micro-organismen gebruikt worden als substraat, in de cel worden opgehoopt, dan wel als product worden uitgescheiden, beschikken we over een assortiment van meettechnieken en meetapparatuur. Beschikbaar zijn:
- Gaschromatografie voor de bepaling van methaan, vluchtige organische zuren en alcoholen.
- HPLC voor de analyse van aminozuren, organische zuren en co-enzymen van de methaanvorming.
- Massaspectrometrie voor het meten van 13C/12C verhoudingen in vaste of gasvormige (CO2) koolstofverbindingen.
- UV-zichtbaar licht spectrosopie bij (colorimetrische) bepalingen van specifieke verbindingen
- Vloeistof-scintillatieteller voor het meten van 14C-gelabelde stoffen